Jugadors que juguen 'EteRNA' acaba de guanyar la ciència professional a aquest descobriment crucial

La ciència ciutadana acaba d’aconseguir el següent nivell: els jugadors de vídeo han fet un descobriment biològic, i ara s’ha publicat per una revista científica revisada per parells.

Publicat aquesta setmana a la pàgina web Journal of Molecular Biology, una sèrie de regles desenvolupades intuïtivament per la dificultat d’una forma particular d’aconseguir a través del disseny d’ARN. Van trobar, per exemple, que la forma més simètrica és, més difícil serà dissenyar un capítol d’ARN que encaixi.

El col·lectiu de videojugadors va fer el descobriment jugant, EteRNA, un joc que desafia als jugadors a prendre filaments d’ARN i els plega a la forma desitjada alterant la seva composició química. El problema científic de plegar ARN en una forma concreta és complex, però el joc no és necessari: no es necessita cap comprensió de la bioquímica per començar a jugar.

Els jugadors van recollir la pregunta d'investigació per iniciativa pròpia, com a forma de donar eines més recents per jutjar la dificultat relativa dels diferents trencaclosques. Els resultats ajudaran a guiar la futura investigació biomèdica, ja que el nou conjunt de regles proporciona als científics un millor sentit de si intentar plegar RNA en una forma determinada és un exercici inútil.

"Aquesta investigació suggereix que el paradigma estàndard del crowdsourcing científic pot ser invertit", explica Rhiju Das, professor de bioquímica de Stanford. Invers en un correu electrònic. EteRNA va ser llançat el 2011 per Das i Adrien Treuille, professor assistent de ciències de la computació a la Carnegie Mellon University. " EteRNA Els jugadors poden dissenyar les seves pròpies preguntes de recerca i poden redactar els seus propis documents. En aquesta investigació, hi va haver una petita orientació i proves independents d’experts del meu laboratori ”.

L'ARN sintetitzat té un potencial increïble per a una nova generació de medicaments i teràpies mèdiques. Si es pot plegar a la forma adequada, es pot construir ARN per orientar virus específics, càncers i fins i tot trastorns genètics. CRISPR, un procés d’edició gènica que pot alterar dramàticament el futur de l’existència humana, utilitza l’ARN per guiar l’enzim de tall de DNA, Cas9, a la secció no desitjada de l’ADN.

EteRNA va començar com un fòrum de científics experts per presentar trencaclosques als jugadors, però des de llavors ha crescut. El joc i els seus 100.000 jugadors registrats existeixen ara en una relació simbiótica i en evolució amb científics professionals i models informàtics construïts per dissenyar i provar l'estructura d'ARN.

"Modelatge i computació EteRNA no són exclusius ", diu Das. " EteRNA reuneix a moltes persones, algunes de les quals estan escrivint els seus propis models informàtics."

En el document actual, els jugadors van escriure scripts de manera col·laborativa per provar les seves idees pel que fa a les estructures d'ARN difícils de dissenyar. Das diu que alguns jugadors li van dir que estaven especialment emocionats d'automatitzar les seves idees en models informàtics perquè volen continuar i resoldre problemes més durs.

Problemes construïts per EteRNA els jugadors continuen sent sintetitzats al laboratori de Das: fins ara s'han construït 86.459 seqüències generades per reproductors IRL.

Els autors principals de l’article van ser EteRNA els jugadors Jeff Anderson-Lee, Eli Fisker, Vineet Kosaraju i Michelle Wu. Wu també és doctor. estudiant d'informàtica biomèdica a Stanford.

En el futur, pot ser que els experts ciutadans comencin a publicar descobriments científics de manera totalment independent.

"Aquesta plantilla d’un" crowdsourcing invertit "per a la ciència ciutadana podria ser útil per a altres projectes i camps de la ciència, com l’astronomia (Galaxy Zoo) o identificació d'espècies generades per multitud Codi de barres de la vida) ”, Diu Das. “Especialment si ells, com EteRNA, estan veient colls d’ampolla a l’escenari del paper ”.